タンパク分解: SOCS ドメイン(領域)
The VHLα domain of human VHL.
ドメインの結合および機能
SOCS ボックスは、元来、サイトカインシグナル伝達抑制(supressors of cytokine signaling, SOCS)タンパク質ファミリーメンバーにおいて同定された、約40アミノ酸残基からなる相同性部位である。SOCS ボックスは常にC末端に局在しており、標的タンパク質のユビキチン化を助けると考えられている。BC ボックスはSOCS とVHLαドメインに共通のサブドメインで、Elongin BC 複合体への結合を促進する。このElongin BC 複合体はまた、VHL(von-Hippel Lindau)腫瘍抑制タンパク質とも相互作用して、より大きなVCB E3 ユビキチンタンパク質リガーゼ複合体のコア(核)を形成する。このような流れから、SOCS ボックス/VHLαドメインは、構造的に関連があり、ユビキチン化の過程で基質をE3 複合体につなぐはたらきを持つF ボックスタンパク質とは同類であるともいえよう。5つの異なる型のN末端部位が、SOCS ボックスのC末端と会合する。それらには、SH2 ドメイン(SOCS タンパク質)、WD40 反復配列(WSB タンパク質)、SPRY ドメイン(SSB タンパク質)、アンキリン(Ankyrin)反復配列(ASB タンパク質)、およびGTPase ドメイン(PAR ファミリー)が含まれる。
構造
SOCS/VHLαドメインは、4つα-ヘリックスのうちの1つが欠けていることを除けば、いわゆる「折りたたまれた葉」の塊を思わせるように固まった3つのα-ヘリックスからできている。Elongin C から出ているヘリックスがこの隙間にはまることによって4つのヘリックスの塊が完成し、二対の互いに直交するヘリックスが詰まったような配置を生み出す。
参考文献
- Stebbins, C.E. et al. (1999) Science 284(5413), 455–461.
例: ドメインタンパク質
例: ドメインタンパク質と結合パートナー
| SOCS Domain Proteins | Binding Partners |
| Socs-1 | Elongin B/C |
| Socs-3 | Elongin B/C |
翻訳監修: 大阪薬科大学 生体防御学研究室 天野富美夫先生
