リン酸化チロシン(Phospho/Tyr)結合: SH2 ドメイン(領域)
Src SH2 domain bound to phosphotyrosine peptide (red).
ドメインの結合および機能
SH2(Src-homology 2; Src相同2)ドメインは、およそ100アミノ酸残基からなるモジュールで、特異的なリン酸化チロシン(pY)含有ペプチドモチーフに結合する。通常のSH2 ドメインはpYを認識する保存されたポケットを持ち、特異性を与えるために、このpYのC末端側3-6アミノ酸残基に結合するさらに可変性のあるポケットを持つ。SAP のSH2 ドメインは、N末端およびC末端の前後のアミノ酸残基においてpYと同様にYを認識することから、時には代替の三つ又モデルが当てはまる可能性がある。至適な配列を持つリン酸化ペプチドは、SH2 ドメインに解離定数約50-500 nMで結合する。
参考文献
- Waksman, G. et al. (1993) Cell 72(5): 779–90.
例: ドメインタンパク質
例: ドメインタンパク質と結合パートナー
| SH2 Domain Proteins | Binding Partners | Phosphopeptide Ligand | SH2 Specificity Residues | |
| Regulation | Specificity | |||
| Src Tyrosine Kinase | Focal Adhesion Kinase | pTyr | -Ala-Glu-Ile | Tyr ΒD5 |
| Phospho-lipase C-γ C-terminal SH2 | PDGF β receptor | pTyr | -Ile-Ile-Pro-Leu-Pro-Asp | Cys ΒD5 |
| Grb2 adaptor | Shc docking protein | pTyr | -Val-Asn-Val | Trp EF1 |
翻訳監修: 大阪薬科大学 生体防御学研究室 天野富美夫先生
